土壤微生物是指在土壤中生活著的種類繁多的微生物，如細菌、放線菌、真菌、土壤藻類和微小動物等。土壤微生物有些對農(nóng)業(yè)有益，有些卻是有害的，土壤微生物是土壤中一個非常重要的組成成分，它對土壤性質(zhì)、土壤肥力的形成及作物生長都有很重要的作用。

首先，在土壤的形成中，其實質(zhì)是土壤有機質(zhì)的合成和分解，而有機質(zhì)的合成和分解都有微生物的參與。微生物是土壤有機質(zhì)積累的先鋒，同時，有機質(zhì)的分解更離不開微生物的作用。由于微生物分解有機質(zhì)釋放養(yǎng)分的作用，就將地殼中有限的營養(yǎng)元素能周而復始的利用，保證整個植物生長發(fā)育對養(yǎng)分無限的要求。在培肥土壤過程中使用各種措施使土壤更適于植物生長的要求，而這些措施主要靠微生物來參加作用。所以通過農(nóng)業(yè)措施來培肥土壤的過程，即農(nóng)業(yè)土壤熟化的過程，很多方面也就是調(diào)節(jié)土壤微生物活動的過程，如耕作、施肥、灌水、排水等措施都適當?shù)卣{(diào)節(jié)了微生物的生態(tài)環(huán)境，促進有益微生物朝著培肥地力的方向發(fā)展，提高土壤肥力。